<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<article article-type="research-article" dtd-version="1.4" xml:lang="en" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">
  <front>
    <journal-meta>
      <journal-id journal-id-type="publisher-id">MedMat</journal-id>
      <journal-title-group><journal-title>MedMat</journal-title></journal-title-group>
      <issn pub-type="epub">2791-3716</issn>
      <publisher><publisher-name>MedMat Press Limited</publisher-name></publisher>
    </journal-meta>
    <article-meta>
      <article-id pub-id-type="doi">10.1097/mm9.0000000000000001</article-id>
      <article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Perspective</subject></subj-group></article-categories>
      <title-group><article-title>Bioorthogonal catalysis for antimicrobial therapy</article-title></title-group>
      <contrib-group><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Gupta</surname><given-names>Aarohi</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Ndugire</surname><given-names>William</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Liu</surname><given-names>Liang</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Chakraborty</surname><given-names>Soham</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Abdelaziz</surname><given-names>Maged</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Rainboth</surname><given-names>Derek</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Rotello</surname><given-names>Vincent M.</given-names></name></contrib></contrib-group>
      
      <pub-date publication-format="electronic" date-type="pub" iso-8601-date="2024-09"><month>09</month><year>2024</year></pub-date>
      <volume>1</volume><issue>1</issue><fpage>2</fpage><lpage>5</lpage>
      <self-uri content-type="html" xlink:href="https://www.medmat.org/article?doi=10.1097%2Fmm9.0000000000000001"/><self-uri content-type="pdf" xlink:href="https://www.medmat.org/articles/pdfs/10-1097-mm9-0000000000000001.pdf"/>
      
      <abstract id="extended-abstract-1" abstract-type="extended" xml:lang="zh-CN" lang-variant="translation"><title>中文长摘要</title><p>生物正交化学利用不干扰自然生物过程的非天然反应，而催化剂的引入使得在复杂生命系统中控制这些反应成为可能。该新兴领域已整合到前药激活、蛋白质转化等多种合成生化反应中。然而，传统抗生素在治疗细菌生物膜和胞内病原体等挑战性感染时往往因无法穿透屏障或浓度不足而失效。随着抗菌耐药性的迅速蔓延及新药研发管道的匮乏，开发新型策略迫在眉睫。本文旨在综述利用生物正交催化在感染部位原位生成高浓度抗菌药物这一前沿策略，以解决抗生素渗透性差和耐药性问题。</p><p>该策略的核心在于将催化剂封装于纳米材料支架中，通过非天然反应实现前药激活或分子偶联。主要机制包括去笼化反应（由过渡金属催化剂TMC介导）和耦合反应（如铜催化的叠氮 - 炔环加成CuAAC）。为解决TMC在生理介质中的疏水性和失活问题，研究设计了阳离子聚合物纳米酶（polyzymes），利用其正电荷增强对带负电生物膜的穿透力。此外，还开发了负载催化剂的红细胞载体及甘露糖修饰的金纳米颗粒，分别用于靶向细菌毒素诱导的溶血释放和巨噬细胞表面的CD206受体摄取，从而实现药物在感染位点的精准定位与原位生成。</p><p>研究证实，阳离子聚合物纳米酶能有效穿透大肠杆菌或铜绿假单胞菌生物膜并激活莫西沙星或环丙沙星前药，且对成纤维细胞表现出优异的生物相容性。利用红细胞作为载体时，负载的铁卟啉催化剂可被细菌毒素特异性裂解，选择性杀灭金黄色葡萄球菌和大肠杆菌生物膜而不引起免疫反应。在胞内感染治疗中，甘露糖修饰的纳米颗粒通过CD206受体进入巨噬细胞，原位生成环丙沙星有效清除沙门氏菌，且未对肠道有益菌群产生毒性。这些发现表明该策略能显著提高抗生素局部浓度并减少脱靶效应。</p><p>生物正交催化为应对耐药性和难治性感染提供了极具潜力的解决方案，其核心优势在于将药物工厂直接部署于感染部位，克服了传统药物的渗透障碍和全身毒性局限。尽管目前展示了在体外及动物模型中的有效性，但过渡金属催化剂的长期体内稳定性、纳米载体的规模化制备以及临床转化路径仍需进一步验证。未来的工作应聚焦于优化光控或近红外激活系统以提高时空分辨率，并探索更多种类的生物正交反应体系以扩大抗菌谱。该领域的发展有望为抗生素耐药性危机提供新的化学工具和治疗范式。</p></abstract><abstract id="extended-abstract-2" abstract-type="extended" xml:lang="fr" lang-variant="translation"><title>Résumé long en français</title><p>La chimie bioorthogonale utilise des réactions abiotiques qui n&apos;interfèrent pas avec les processus biologiques naturels, et l&apos;intégration de catalyseurs permet le contrôle localisé de ces réactions au sein de systèmes vivants complexes. Ce domaine émergent a été appliqué à la prodrogue activation, la transformation protéique et l&apos;ingénierie cellulaire. Cependant, les antibiotiques traditionnels échouent souvent face aux infections persistantes comme les biofilms bactériens ou les pathogènes intracellulaires en raison d&apos;une pénétration insuffisante et de concentrations locales inadéquates. Face à la propagation alarmante des résistances antimicrobiennes et au manque de nouveaux antibiotiques, cette approche offre une solution potentielle pour générer in situ des agents thérapeutiques actifs directement sur le site infecté.</p><p>L&apos;approche repose sur l&apos;utilisation de catalyseurs encapsulés dans des échafaudages nanomatériaux pour activer les prodrogues via deux mécanismes principaux : la réaction d&apos;élimination (caging) par un catalyseur métallique à transition (TMC) et les réactions de couplage comme l&apos;azoture-alcyne cycloaddition (CuAAC). Pour surmonter l&apos;inactivité des TMC en milieu physiologique, des polymères cationiques chargés positivement ont été conçus pour pénétrer la couche négative des biofilms. Des stratégies avancées incluent le greffage de nanoparticules d&apos;or contenant du fer sur les globules rouges (RBC) pour une libération déclenchée par les toxines bactériennes, et l&apos;utilisation de nanocatalyseurs fonctionnalisés au mannose ciblant spécifiquement les récepteurs CD206 des macrophages infectés.</p><p>Les résultats démontrent que ces polyzymes chargées positivement activent efficacement la moxifloxacine ou la ciprofloxacine protégée par un groupe aryl-azide au sein de biofilms d&apos;Escherichia coli et Pseudomonas aeruginosa, tout en montrant une faible toxicité pour les cellules fibroblastes NIH/3T3. L&apos;utilisation des globules rouges comme véhicules permet l&apos;éradication sélective des biofilms sans réponse immunitaire significative, tandis que la stratégie de ciblage du mannose dans les macrophages génère localement assez d&apos;antibiotique pour tuer Salmonella intracellulaire sans affecter les bactéries intestinales bénéfiques comme Lactobacillus. Ces données confirment la capacité des catalyseurs bioorthogonaux à agir comme usines de médicaments ciblées, minimisant ainsi les effets hors cible.</p><p>Cette stratégie représente une avancée majeure pour contourner les barrières physiques et biologiques qui limitent l&apos;efficacité des antibiotiques classiques contre les infections récalcitrantes. Bien que prometteuse, la traduction clinique nécessite encore d&apos;améliorer la stabilité à long terme des catalyseurs métalliques dans le corps humain et de valider leur sécurité sur une plus grande échelle avant essais cliniques. Les travaux futurs devront explorer l&apos;optimisation des systèmes activés par lumière infrarouge proche pour un meilleur contrôle temporel, ainsi que l&apos;élargissement du spectre d&apos;action à travers la découverte de nouvelles paires réactives bioorthogonales compatibles avec divers environnements pathologiques. L&apos;intégration continue de ces outils chimiques pourrait révolutionner le traitement des infections résistantes aux médicaments.</p></abstract><abstract id="extended-abstract-3" abstract-type="extended" xml:lang="ja" lang-variant="translation"><title>日本語長文要旨</title><p>生体直交化学は、自然な生物学的過程に干渉しない非天然反応を利用する技術であり、触媒の導入により複雑な生命システム内でこれらの反応を局所的に制御し、活性分子を生産することが可能になります。この分野は前薬活性化やタンパク質変換などに応用されていますが、従来の抗生物質は細菌バイオフィルムや細胞内病原体に対する治療において、十分な濃度で膜や層を透過できないという課題を抱えています。抗菌耐性の急速な拡大と新規薬剤開発の不足により、感染部位での局所的かつ継続的な抗菌薬生成を目指す生体直交触媒戦略が新たな解決策として注目されています。</p><p>本アプローチは、遷移金属触媒（TMC）をナノ材料スケールに封入し、脱カゴ反応やカップリング反応を通じて前薬を活性化するものです。生理環境での不溶性と失活を防ぐため、陽イオン性ポリマーを用いた「ポライザム」が設計され、負電荷を持つバイオフィルムへの浸透性を高めています。さらに、細菌毒素による溶血を利用した赤血球（RBC）キャリアや、マクロファージ表面のCD206受容体を標的とするマンノース修飾金ナノ粒子の開発が進められています。これらはそれぞれ感染部位での選択的な薬剤放出と細胞内への取り込みを可能にし、局所的な抗菌薬生成を実現します。</p><p>研究により、陽イオン性ポライザムが大腸菌や銅緑假単胞菌のバイオフィルム内でアジル基保護されたモキシフロキサシンやシプロフロキサシンを効率的に活性化し、線維芽細胞に対する毒性が極めて低いことが確認されました。赤血球キャリアを用いた場合、細菌毒素によって特異的に分解され、非病原性菌株やマクロファージへの影響なくバイオフィルムを除去できます。また、マンノース標的化により感染したマクロファージ内に選択的に取り込まれた触媒がシプロフロキサシンを生成し、細胞内サルモネラ菌を殺菌すると同時に腸管の有益な乳酸桿菌には無害であることが示されました。</p><p>生体直交催化は、難治性感染に対する抗生物質の浸透性と耐性という二重の課題に対処する有望な解決策を提供しますが、臨床応用に向けて触媒の体内長期安定性の確認やナノキャリアの大規模製造プロセスの確立が必要です。将来的には、近赤外光による制御システムの最適化により時間・空間分解能を高め、より多様な生体直交反応系を開発して抗菌スペクトラムを広げる研究が求められます。この分野は既存抗生物質の有効利用と新規治療法の開発において重要な役割を果たし、薬剤耐性危機に対する新たな化学的ツールとして期待されています。</p></abstract><abstract id="extended-abstract-4" abstract-type="extended" xml:lang="es" lang-variant="translation"><title>Resumen extenso en español</title><p>La química bioortogonal utiliza reacciones abióticas que no interfieren con los procesos biológicos naturales, y la incorporación de catalizadores permite controlar estas reacciones dentro de sistemas vivos complejos para generar moléculas bioactivas localizadas. Este campo emergente se ha integrado en diversas aplicaciones como la activación de profármacos y la ingeniería celular. Sin embargo, los antibióticos tradicionales fallan frecuentemente contra infecciones desafiantes como las biopelículas bacterianas o patógenos intracelulares debido a su incapacidad para penetrar barreras físicas en concentraciones suficientes. Ante el alarmante aumento de la resistencia antimicrobiana y la escasez de nuevos antibióticos, esta estrategia ofrece una solución potencial mediante la generación in situ de agentes terapéuticos directamente en el sitio de infección.</p><p>El enfoque se basa en encapsular catalizadores metálicos de transición (TMC) dentro de andamios nanomateriales para activar profármacos mediante reacciones de desenmascaramiento o acoplamiento, como la cicloadición azida-alquino (CuAAC). Para superar la hidrofobicidad y desactivación de los TMC en medios fisiológicos, se diseñaron polímeros catiónicos cargados positivamente que facilitan la penetración en biopelículas con carga negativa. Estrategias avanzadas incluyen el uso de glóbulos rojos (RBC) como vehículos para liberar catalizadores sensibles a toxinas bacterianas y nanopartículas funcionalizadas con manosa dirigidas específicamente a los receptores CD206 en macrófagos infectados, logrando así una acumulación selectiva del fármaco.</p><p>Los hallazgos demuestran que estos nanocatalizadores poliméricos activan eficientemente moxifloxacina o ciprofloxacina protegidas por grupos aril-azida dentro de biopelículas de Escherichia coli y Pseudomonas aeruginosa, mostrando excelente biocompatibilidad con células fibroblásticas NIH/3T3. El uso de glóbulos rojos permite la erradicación selectiva de biofilms sin respuesta inmune significativa, mientras que el sistema dirigido a macrófagos genera localmente suficiente ciprofloxacina para eliminar Salmonella intracelular sin afectar bacterias intestinales beneficiosas como Lactobacillus. Estos resultados confirman la capacidad de los catalizadores bioortogonales para actuar como fábricas de medicamentos dirigidas, minimizando efectos fuera del objetivo.</p><p>Esta estrategia representa una solución prometedora para superar las limitaciones físicas y biológicas que restringen la eficacia de los antibióticos convencionales contra infecciones recalcitrantes. Aunque ha demostrado éxito en modelos experimentales, su traducción clínica requiere validar la estabilidad a largo plazo de los catalizadores metálicos in vivo y optimizar procesos de fabricación escalables. El trabajo futuro debe centrarse en mejorar sistemas activados por luz infrarroja cercana para un control temporal preciso y explorar nuevas parejas reactivas bioortogonales para ampliar el espectro antibacteriano, consolidando así esta tecnología como una herramienta química vital frente a la crisis global de resistencia antimicrobiana.</p></abstract><abstract id="extended-abstract-5" abstract-type="extended" xml:lang="ar" lang-variant="translation"><title>الملخص العربي الموسّع</title><p>تستخدم الكيمياء الحيوية غير المتداخلة تفاعلات لا تتداخل مع العمليات البيولوجية الطبيعية، ويوفر استخدام المحفزات القدرة على التحكم في التفاعلات غير الأصلية داخل الأنظمة الحية المعقدة، مما يتيح توليد محلي للجزيئات النشطة بيولوجيًا. وقد تم دمج هذا المجال الناشئ في مجموعة واسعة من التطبيقات بما في ذلك تنشيط الأدوية الأولية وتحويل البروتينات. ومع ذلك، فإن المضادات الحيوية التقليدية غالبًا ما تفشل في علاج الالتهابات الصعبة مثل الأغشية الحيوية البكتيرية والعدوى داخل الخلايا بسبب عدم قدرتها على اختراق الحواجز بتركيزات كافية. وفي ظل الانتشار المقلق لمقاومة مضادات الميكروبات ونقص الأدوية الجديدة، تقدم استراتيجية التحفيز الحيوي غير المتداخل حلاً محتملاً من خلال التوليد في الموقع للعوامل العلاجية مباشرة عند موقع العدوى.</p><p>يعتمد هذا النهج على تغليف المحفزات المعدنية الانتقالية (TMC) داخل هياكل نانوية لتفعيل الأدوية الأولية عبر تفاعلات إزالة الحماية أو الاقتران مثل إضافة حلقة الآزويد-الألكين. ولتجاوز مشكلة عدم ذوبانية وفقدان نشاط هذه المحفزات في الوسط الفسيولوجي، تم تصميم بوليمرات موجبة الشحنة لتعزيز اختراق الأغشية الحيوية سالبة الشحنة. وتشمل الاستراتيجيات المتقدمة استخدام خلايا الدم الحمراء كوسيلة لنقل المحفزات التي يتم تحريرها استجابة لسموم البكتيريا، واستخدام جسيمات نانوية ذهبية مغطاة بالمانوز لاستهداف مستقبلات CD206 على سطح البلاعم المصابة، مما يضمن تراكمًا انتقائيًا للدواء في موقع الإصابة.</p><p>أظهرت النتائج أن هذه المحفزات النانوية البوليمرية تنشط بفعالية أدوية مثل موكسيفلوكساسين وسيبروفلوكساسين محمية بمجموعات الآزويد الأريلية داخل الأغشية الحيوية، مع إظهار توافق حيوي ممتاز مع الخلايا الليفية. كما سمح استخدام خلايا الدم الحمراء بالتخلص الانتقائي من الأغشية الحيوية دون استجابة مناعية كبيرة، بينما مكّن النظام الموجه للبلاعم من توليد سيبروفلوكساسين محليًا لقتل السالمونيلا داخل الخلايا دون الإضرار بالبكتيريا المعوية المفيدة. وتؤكد هذه النتائج قدرة المحفزات الحيوية غير المتداخلة على العمل كمصانع أدوية موجهة تقلل الآثار الجانبية خارج الهدف.</p><p>تمثل هذه الاستراتيجية حلاً واعدًا للتغلب على العقبات الفيزيائية والبيولوجية التي تحد من فعالية المضادات الحيوية التقليدية ضد الالتهابات المستعصية. ورغم نجاحها في النماذج التجريبية، فإن التطبيق السريري يتطلب التحقق من الاستقرار طويل الأمد للمحفزات المعدنية داخل الجسم البشري وتحسين عمليات التصنيع على نطاق واسع. يجب أن تركز الأعمال المستقبلية على تحسين أنظمة التنشيط بالضوء تحت الأحمر للتحكم الدقيق زمنيًا ومكانيًا، واستكشاف أزواج تفاعلية جديدة لتوسيع الطيف المضاد للبكتيريا، مما يعزز من دور هذه التقنية كأداة كيميائية حيوية في مواجهة أزمة مقاومة الأدوية عالميًا.</p></abstract>
      <permissions><copyright-year>2024</copyright-year><copyright-holder>The Authors</copyright-holder></permissions>
      <custom-meta-group><custom-meta><meta-name>multilingual-summary-status</meta-name><meta-value>AI-assisted extended summaries derived from the article abstract or full text for discovery; the peer-reviewed English article remains the version of record.</meta-value></custom-meta></custom-meta-group>
    </article-meta>
  </front>
  <body/>
  <back/>
</article>
