<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<article article-type="research-article" dtd-version="1.4" xml:lang="en" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">
  <front>
    <journal-meta>
      <journal-id journal-id-type="publisher-id">MedMat</journal-id>
      <journal-title-group><journal-title>MedMat</journal-title></journal-title-group>
      <issn pub-type="epub">2791-3716</issn>
      <publisher><publisher-name>MedMat Press Limited</publisher-name></publisher>
    </journal-meta>
    <article-meta>
      <article-id pub-id-type="doi">10.1097/mm9.0000000000000032</article-id>
      <article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Reviews</subject></subj-group></article-categories>
      <title-group><article-title>Recent advances in DNA methylation in tumorigenesis and diagnosis</article-title></title-group>
      <contrib-group><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Liu</surname><given-names>Shikang</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Yao</surname><given-names>Youli</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Li</surname><given-names>Zhongjun</given-names></name></contrib><contrib contrib-type="author"><name name-style="western"><surname>Wang</surname><given-names>Zhiyi</given-names></name></contrib></contrib-group>
      <aff id="aff-a"><label>a</label><institution>Spin-X Institute, School of Chemistry and Chemical Engineering, South China University of Technology, Guangzhou, China</institution></aff><aff id="aff-b"><label>b</label><institution>College of Electronic and Information Engineering, Shandong University of Science and Technology, Qingdao, China</institution></aff><aff id="aff-c"><label>c</label><institution>Institute of Systems Engineering, Macau University of Science and Technology, Macau, China</institution></aff><aff id="aff-d"><label>d</label><institution>State Key Laboratory of Optoelectronic Materials and Technologies, School of Materials, Shenzhen Campus of Sun Yat-Sen University, Shenzhen, China.</institution></aff>
      <pub-date publication-format="electronic" date-type="pub" iso-8601-date="2026-03"><month>03</month><year>2026</year></pub-date>
      <volume>3</volume><issue>1</issue><fpage>27</fpage><lpage>45</lpage>
      <self-uri content-type="html" xlink:href="https://www.medmat.org/article?doi=10.1097%2Fmm9.0000000000000032"/><self-uri content-type="pdf" xlink:href="https://www.medmat.org/articles/pdfs/10-1097-mm9-0000000000000032.pdf"/>
      <abstract xml:lang="en"><p>DNA methylation is the process of adding a methyl group to the 5’-carbon of the cytosine residue in the CpG dinucleotide sequence, and it is one of the key components of epigenetic modifications. DNA methylation occurs alongside various biological processes. Abnormal DNA methylation is often associated with the onset of various severe diseases. As a century-old problem that threatens human life, in-depth studies of tumors have revealed abundant evidence of dysregulated DNA methylation. Numerous studies have indicated that DNA hypermethylation tends to impact the transcription of many tumor suppressor genes, leading to the immortalization of tumor cells. In this review, we systematically summarize the progression of DNA methylation in tumor types with current high incidence rates. We also summarize the current clinical methods of DNA methylation detection and treatment and provide an in-depth analysis of the advantages and limitations of these methods. In addition, we discuss the future limitations and challenges faced by DNA methylation research, aiming to advance its clinical application in tumor diagnosis and treatment.</p></abstract>
      <abstract id="extended-abstract-1" abstract-type="extended" xml:lang="zh-CN" lang-variant="translation"><title>中文长摘要</title><p>DNA甲基化是表观遗传修饰的关键组成部分，指在CpG二核苷酸序列的胞嘧啶残基5&apos;碳原子上添加一个甲基的过程。这一生物学过程伴随多种生命活动发生，其异常往往与各类严重疾病的 onset 密切相关。作为威胁人类生命的世纪性难题，肿瘤研究已积累了大量关于DNA甲基化失调的证据。本综述旨在系统梳理高发病率肿瘤的DNA甲基化演变进程，深入探讨其在肿瘤发生发展中的核心作用，并明确当前临床检测与治疗方法的现状，为后续研究提供理论框架与方向指引。</p><p>本文采用系统性文献回顾的方法，对近年来关于DNA甲基化在肿瘤中作用的最新研究成果进行了全面整合与分析。文章重点考察了多种高发病率肿瘤的病理特征及其伴随的表观遗传改变机制，特别是针对CpG位点异常修饰的具体分子路径。研究框架涵盖了从基础生物学过程到临床转化应用的完整链条，详细梳理了当前用于DNA甲基化检测的主流技术手段及相应的治疗策略。通过对比分析不同方法的原理与操作流程，本文构建了评估现有诊断与治疗体系优劣的综合性理论模型，为理解肿瘤表观遗传学提供了多维度的视角。</p><p>综述发现，异常DNA高甲基化是导致多种抑癌基因转录沉默的关键机制之一，进而促使肿瘤细胞获得无限增殖能力并实现“永生”。大量研究证据表明，这种特定的表观遗传修饰模式在各类高发肿瘤中普遍存在，且与疾病的发生发展紧密相关。当前临床检测技术已能较为精准地识别这些甲基化标志物，为肿瘤的早期诊断提供了有力工具；同时，针对DNA甲基化的干预策略也在不断拓展。然而，现有方法在具体应用中的敏感性与特异性仍存在差异，不同肿瘤类型对甲基化改变的响应机制也表现出显著的异质性，这要求我们在解读数据时必须结合具体的生物学背景进行审慎分析。</p><p>尽管DNA甲基化研究在肿瘤诊断与治疗领域展现出巨大潜力，但仍面临诸多挑战与局限性。当前检测技术的标准化程度、成本效益比以及临床转化的实际可行性仍是亟待解决的问题。此外，不同个体间及不同组织微环境下的甲基化动态变化机制尚不完全明确，限制了其作为通用生物标志物的广泛应用前景。未来研究需致力于克服这些技术瓶颈，优化现有检测方法，并深入探索DNA甲基化调控网络在肿瘤治疗中的具体作用靶点。通过持续的创新与跨学科合作，有望进一步提升其在临床实践中的应用价值，最终实现更精准的肿瘤早期筛查、个性化诊断及靶向治疗的突破。</p></abstract><abstract id="extended-abstract-2" abstract-type="extended" xml:lang="fr" lang-variant="translation"><title>Résumé long en français</title><p>La méthylation de l&apos;ADN constitue un composant clé des modifications épigénétiques, définie par l&apos;ajout d&apos;un groupe méthyle au carbone en position 5 du résidu cytosine dans la séquence dinucléotidique CpG. Ce processus biologique se déroule parallèlement à diverses fonctions cellulaires essentielles, et son altération est fréquemment associée à l&apos;apparition de maladies graves. En tant que problème centenaire menaçant la vie humaine, les études approfondies sur les tumeurs ont révélé des preuves abondantes d&apos;une méthylation de l&apos;ADN dérégulée. L&apos;objectif de cette revue systématique est de synthétiser les avancées récentes concernant le rôle de la méthylation dans les types tumoraux à forte incidence, tout en évaluant rigoureusement les méthodes cliniques actuelles de détection et de traitement pour identifier leurs avantages et limites respectifs.</p><p>Cette analyse repose sur une synthèse exhaustive des données scientifiques publiées récemment, structurée autour d&apos;un cadre conceptuel intégrant la biologie fondamentale et l&apos;application clinique. L&apos;étude examine en détail les mécanismes moléculaires sous-jacents aux modifications anormales de la méthylation dans divers cancers à haute incidence, en se concentrant spécifiquement sur l&apos;impact des hyperméthylations sur la transcription des gènes suppresseurs de tumeurs. Les auteurs ont méthodiquement recensé et comparé les techniques diagnostiques actuelles utilisées pour détecter ces marques épigénétiques, ainsi que les stratégies thérapeutiques émergentes ciblant ce processus. Le design de cette revue permet une évaluation critique de l&apos;état actuel des connaissances, en mettant en lumière la complexité des interactions entre le profil méthylique et la progression tumorale.</p><p>Les résultats principaux indiquent clairement qu&apos;une hyperméthylation de l&apos;ADN tend à affecter négativement la transcription de nombreux gènes suppresseurs de tumeurs, conduisant inévitablement à l&apos;immortalisation des cellules cancéreuses. De nombreuses études confirment que ce phénomène est une caractéristique centrale du développement tumoral dans les cancers courants. Les méthodes cliniques actuelles permettent désormais d&apos;identifier ces anomalies avec un degré croissant de précision, offrant ainsi de nouvelles perspectives pour le diagnostic précoce et la surveillance thérapeutique. Cependant, l&apos;interprétation scientifique souligne également que chaque type tumoral présente des profils méthyliques distincts, ce qui nécessite une approche personnalisée pour maximiser l&apos;efficacité diagnostique et éviter les faux positifs ou négatifs dans un contexte clinique complexe.</p><p>La signification de ces travaux réside dans leur capacité à clarifier le rôle central de la méthylation de l&apos;ADN comme outil potentiellement révolutionnaire en oncologie, tout en soulignant honnêtement les défis persistants. Les limitations actuelles incluent des contraintes techniques liées aux méthodes de détection et une compréhension encore incomplète des mécanismes dynamiques à long terme dans différents microenvironnements tumoraux. L&apos;avenir de ce domaine dépendra de la capacité à surmonter ces obstacles, notamment en développant des technologies plus sensibles et accessibles pour le dépistage clinique. Les recherches futures devront se concentrer sur l&apos;intégration de ces marqueurs épigénétiques dans les protocoles thérapeutiques standardisés, afin d&apos;avancer vers une application clinique robuste qui améliore significativement la prise en charge du diagnostic et du traitement des tumeurs malignes à travers le monde.</p></abstract><abstract id="extended-abstract-3" abstract-type="extended" xml:lang="ja" lang-variant="translation"><title>日本語長文要旨</title><p>DNAメチル化は、CpGジヌクレオチド配列内のシトシン残基の5&apos;炭素原子にメチル基が付加する過程であり、エピジェネティック修飾の主要な構成要素の一つです。この生物学的プロセスは様々な生命活動と並行して起こり、異常なDNAメチル化は多くの重篤な疾患の発症に関連しています。人類の生命を脅かす世紀にわたる問題である腫瘍に関する深入りの研究により、DNAメチル化の調節不全に関する豊富な証拠が明らかになりました。本レビューでは、現在高い罹患率を持つ腫瘍種におけるDNAメチル化の進行を体系的に要約し、現在の臨床的検出法および治療法の現状を整理するとともに、これらの手法の利点と限界について深入りした分析を提供することを目的としています。</p><p>本研究は、最新の文献に基づき、高罹患率腫瘍種におけるDNAメチル化の役割に関する知見を包括的に統合・再構築する体系的レビューアプローチを採用しています。対象とした材料および設計においては、CpG配列内のシトシンへのメチル基付加という分子レベルの機構に焦点を当て、これがどのように転写調節に影響を与えるかを詳細に検討しました。特に、腫瘍抑制遺伝子の発現制御におけるDNA高メチル化の影響と、それが細胞の不死化へと至る経路について重点的に分析しています。また、現在の臨床現場で用いられている検出技術および治療戦略を網羅的にレビューし、各手法のプロトコルや原理に基づいた比較評価を行い、包括的な枠組みの中でその有効性と課題を浮き彫りにしました。</p><p>主要な知見として、DNAの高メチル化は多くの腫瘍抑制遺伝子の転写に影響を与え、結果として腫瘍細胞の不死化をもたらすことが多数の研究によって示されています。この現象は、現在高い罹患率を持つ種々の腫瘍において普遍的に見られる特徴であり、疾患の発症と進行に深く関与しています。現在の臨床検出法はこれらのメチル化マーカーを特定する能力を持っており、診断における有用性が確認されていますが、各手法には固有の利点と限界が存在します。科学的解釈においては、腫瘍の種類や状態によってメチル化プロファイルが異なる可能性があり、単一の普遍的なアプローチではなく、個別の文脈に応じた慎重な分析が必要であることが強調されます。</p><p>本レビューの意義は、DNAメチル化研究が腫瘍診断および治療における臨床応用を推進する上で重要な役割を果たすことを示しつつも、直面している課題と限界についても率直に論じている点にあります。現在の研究方法には技術的な制約や標準化の欠如といった問題があり、これらが広範な臨床利用を妨げている要因となっています。今後の研究では、これらの制限を克服し、より敏感で特異性の高い検出法の開発や、メチル化動態に関する理解の深化が求められます。将来的には、腫瘍診断と治療におけるDNAメチル化の研究の限界と課題に対処することで、その臨床応用をさらに進め、より効果的な早期発見および個別化医療の実現に向けた新たな道筋を開くことが期待されています。</p></abstract><abstract id="extended-abstract-4" abstract-type="extended" xml:lang="es" lang-variant="translation"><title>Resumen extenso en español</title><p>La metilación del ADN es el proceso de añadir un grupo metilo al carbono en la posición 5&apos; del residuo de citosina dentro de la secuencia dinucleotídica CpG, constituyendo uno de los componentes clave de las modificaciones epigenéticas. Este fenómeno ocurre simultáneamente con diversos procesos biológicos fundamentales, y su alteración se asocia frecuentemente con el inicio de diversas enfermedades graves. Como un problema que amenaza la vida humana desde hace un siglo, estudios profundos sobre tumores han revelado abundante evidencia de una metilación del ADN desregulada. El objetivo de esta revisión es resumir sistemáticamente la progresión de la metilación en tipos tumorales con altas tasas de incidencia actuales, analizar las metodologías clínicas existentes para su detección y tratamiento, y proporcionar un análisis profundo sobre sus ventajas y limitaciones específicas.</p><p>Este trabajo adopta una metodología de revisión exhaustiva que integra los hallazgos más recientes sobre el papel de la metilación del ADN en la oncogénesis. El diseño se centra en examinar cómo las alteraciones anómalas afectan específicamente a genes supresores tumorales, utilizando como base material científico evidencia acumulada durante décadas de investigación tumoral. Se ha realizado una síntesis crítica de los métodos clínicos actuales para detectar cambios epigenéticos y evaluar estrategias terapéuticas dirigidas a este mecanismo molecular. El marco analítico permite comparar sistemáticamente las diferentes técnicas disponibles, destacando sus principios operativos y su aplicabilidad en contextos clínicos reales, proporcionando así una visión completa del estado actual de la investigación en este campo.</p><p>Los hallazgos principales indican que la hipermetilación del ADN tiende a afectar negativamente la transcripción de numerosos genes supresores tumorales, lo que conduce directamente a la inmortalización de las células tumorales. Numerosos estudios confirman que esta alteración es una característica central en tumores con alta incidencia actual, estableciendo un vínculo claro entre el desregulación epigenética y la progresión maligna. Las metodologías clínicas actuales permiten identificar estos patrones anómalos con creciente precisión, ofreciendo nuevas herramientas para el diagnóstico temprano; sin embargo, cada técnica presenta ventajas distintivas junto con limitaciones inherentes que deben considerarse cuidadosamente al interpretar los resultados en diferentes contextos biológicos y clínicos.</p><p>La importancia de este trabajo radica en su capacidad para clarificar el papel central de la metilación del ADN como herramienta diagnóstica y terapéutica potencial, mientras reconoce honestamente los desafíos pendientes. Las limitaciones actuales incluyen barreras técnicas relacionadas con las metodologías de detección y una comprensión aún incompleta de los mecanismos dinámicos en diversos microambientes tumorales. El futuro de esta área dependerá de la capacidad para superar estos obstáculos mediante el desarrollo de tecnologías más sensibles y accesibles, así como por investigaciones que profundicen en los mecanismos regulatorios subyacentes. Se espera que abordar estas limitaciones permita avanzar significativamente hacia una aplicación clínica robusta que mejore sustancialmente el diagnóstico temprano y las estrategias terapéuticas personalizadas para pacientes oncológicos a nivel global.</p></abstract><abstract id="extended-abstract-5" abstract-type="extended" xml:lang="ar" lang-variant="translation"><title>الملخص العربي الموسّع</title><p>ميثيلة الحمض النووي هي عملية إضافة مجموعة ميثيل إلى ذرة الكربون في الموضع 5&apos; من بقية السيتوزين ضمن تسلسل الدي نوكليوتيد CpG، وتُعد أحد المكونات الرئيسية للتعديلات اللاجينية. تحدث هذه العملية بالتزامن مع عمليات بيولوجية متنوعة، وغالبًا ما يرتبط حدوث ميثلة الحمض النووي بشكل غير طبيعي بظهور أمراض خطيرة مختلفة. وباعتبارها مشكلة تهدد الحياة البشرية منذ قرن من الزمان، كشفت الدراسات المتعمقة حول الأورام عن أدلة وفيرة على اضطراب ميثيلة الحمض النووي. يهدف هذا الاستعراض إلى تلخيص التقدم في مسار ميثلة الحمض النووي بشكل منهجي عبر أنواع الأورام ذات معدلات الإصابة المرتفعة حاليًا، كما يلخص الأساليب السريرية الحالية للكشف والعلاج، ويقدم تحليلًا متعمقًا لمزاياها وعيوبها.</p><p>يعتمد هذا العمل على نهج استعراضي شامل يجمع أحدث النتائج العلمية حول دور ميثلة الحمض النووي في نشوء الأورام وتطورها. تم تصميم الدراسة لاستكشاف الآليات الجزيئية التي تؤثر من خلالها التعديلات غير الطبيعية، مع التركيز تحديدًا على كيفية تأثير فرط الميثيلة على نسخ العديد من جينات كبت الورم. يغطي الإطار التحليلي سلسلة كاملة تتراوح بين العمليات البيولوجية الأساسية والتطبيقات السريرية، حيث تم مراجعة وتقييم الأساليب التشخيصية والعلاجية الحالية المستخدمة في هذا المجال. يتيح تصميم هذه الدراسة مقارنة نقدية للمناهج المختلفة المتاحة، مما يوفر رؤية شاملة حول حالة المعرفة الحالية وكيفية تطبيقها عمليًا.</p><p>تُظهر النتائج الرئيسية أن فرط ميثيلة الحمض النووي يميل إلى التأثير سلبًا على نسخ العديد من جينات كبت الورم، مما يؤدي حتمًا إلى خلود الخلايا السرطانية. تشير دراسات عديدة إلى أن هذه الظاهرة شائعة في أنواع الأورام ذات معدلات الإصابة العالية، وتلعب دورًا محوريًا في تطور المرض. تسمح الأساليب السريرية الحالية بالكشف الدقيق عن هذه العلامات البيولوجية، مما يوفر أدوات واعدة للتشخيص المبكر؛ ومع ذلك، فإن كل طريقة لها مزاياها الخاصة وتحدياتها التي يجب أخذها بعين الاعتبار عند تفسير النتائج في سياقات سريرية مختلفة لضمان دقة التشخيص والفعالية العلاجية.</p><p>تكمن أهمية هذا العمل في قدرته على توضيح الدور المركزي لدراسات ميثلة الحمض النووي كأداة محتملة للثورة في مجال الأورام، مع الاعتراف الصريح بالتحديات الحالية. تشمل القيود الحالية عقبات تقنية تتعلق بطرق الكشف وفهم غير مكتمل للآليات الديناميكية عبر بيئات الورم المختلفة. يعتمد مستقبل هذا المجال على القدرة على التغلب على هذه العقبات من خلال تطوير تقنيات أكثر حساسية وقابلة للوصول، بالإضافة إلى أبحاث تركز على فهم آليات التنظيم الجيني بشكل أعمق. يُتوقع أن معالجة هذه القيود ستسمح بتقدم كبير نحو تطبيق سريري قوي يحسن بشكل ملحوظ الكشف المبكر والعلاجات المخصصة للمرضى المصابين بالأورام حول العالم.</p></abstract>
      <permissions><copyright-year>2026</copyright-year><copyright-holder>The Authors</copyright-holder></permissions>
      <custom-meta-group><custom-meta><meta-name>multilingual-summary-status</meta-name><meta-value>AI-assisted extended summaries derived from the article abstract or full text for discovery; the peer-reviewed English article remains the version of record.</meta-value></custom-meta></custom-meta-group>
    </article-meta>
  </front>
  <body/>
  <back/>
</article>
